如果尚未放苗，应先把塘里的丝藻捞走，并排干水，重新清塘。

忌用药物将丝藻杀死并留在塘底，因为丝状藻类在塘底发酵腐烂可产生有害物质，影响放苗后虾苗的生长。如果已经放苗，可一次性加入大量含浮游微藻的塘水（熟称“较肥”的水），并追加芽孢杆菌制剂和浮游微藻营养素培养水色。如果丝藻不多，可以不必加水，只需多开增氧机，加芽孢杆菌制剂稳定水质即可，因为少量丝状藻类对对虾生长并无大碍。忌用药杀死丝状藻类。