木瓜盆景的修剪以在春季和夏季进行，也就是春剪和夏剪。

但在冬季相对比较暖和且不容易遭受冻害的南方许多地区，有时也可以进行修剪的。但冬季修剪后留下的伤口，如果口径在2公分以上的话，需要用石蜡、泥浆等对其进行密封处理以起到保护作用，促进伤口的愈合。