菠菜种子催芽的时间是三天。

播种前菠菜种子可以适当进行催芽，这样能够节省育苗时间。催芽方法较为简单，将菠菜种子放入清水当中浸泡12小时左右，捞出搓掉种子上的粘液，然后放在湿布上进行催芽，一般三天左右菠菜种子就能出芽，此时就能够进行播种了。菠菜种子可以直接撒播，每亩的用种量在5公斤左右，如果播种时间较晚的话，播种量可以适当增加。播种后覆盖一层薄土，保持土壤湿润，5天到7天左右菠菜就能完成出苗过程。